Kenojuak manifeste une prédilection pour les oiseaux, thème qu'elle renouvelle sans cesse en donnant libre cours à son imagination dans l'exploration de la ligne, de la forme et de la couleur. Selon elle, le motif de l'oiseau n'est rattaché à aucune symbolique particulière dans son œuvre, sinon qu'il semble jaillir de la pointe de son crayon à mesure qu'elle dessine. Elle a aussi abordé d'autres sujets, scènes de campements, chamans, déesses de la mer et métamorphoses (dont celles d'humains en animaux). Elle s'est également intéressée au visage féminin et l'a intégré à une variété de motifs décoratifs. Elle a représenté des divinités et des personnages de légende, mais il reste que les motifs l'intéressent encore plus que les récits.